Yongdzin Rinpoche nasceu em 1926, em Khyungpo Karru no distrito Khyunpo da província de Kham, no leste do Tibete. Aos 7 anos ele entrou Tengchen Mosteiro, um mosteiro local onde seu tio serviu como líder de canto. Lá, ele entrou em um curso extensivo de educação, e aos 14 anos, ele tomou seus votos como um monge.
Em 1940, aos 15 anos, o jovem monge viajou com o tio para Yungdrung Ling, um importante mosteiro Bön no Tibete central. De 1940 a 1942 ele passou muito tempo lá ajudando a executar pinturas de parede, fazendo uso de sua formação desde os 11 anos como artista e pintor. No final de 1942, ele foi em peregrinação no Nepal e Tibet ocidental, retornando ao Yungdrung Ling, em meados de 1943 para começar seus estudos em filosofia.
